| 대수 | 이름 | 임기 | 비고 |
| 초대 | 나기정 (羅基正) | 1995년 07월 01일 ~ 1997년 04월 30일 | [기초단체장] |
| 2대 | 구돈회 (具惇會) | 1997년 05월 17일 ~ 1997년 10월 10일 | |
| 3대 | 한대수 (韓大洙) | 1997년 10월 20일 ~ 1999년 11월 02일 | [기초단체장] |
| 4대 | 유의재 (兪義在) | 1999년 11월 03일 ~ 2002년 07월 14일 | |
| 5대 | 안재헌 (安載憲) | 2002년 07월 15일 ~ 2003년 03월 02일 | [차관급]
[대학총장]
[공공기관장] |
| 6대 | 김영호 (金榮浩) | 2003년 03월 06일 ~ 2005년 04월 24일 | [차관급]
[대학총장]
[공공기관장] |
| 직무대리 | 이재충 (李在忠) | 2005년 04월 25일 ~ 2006년 03월 05일 | |
| 7대 | 2006년 03월 06일 ~ 2007년 09월 30일 |
| 8대 | 이종배 (李鐘培) | 2007년 10월 01일 ~ 2009년 03월 11일 | [국회의원]
[기초단체장]
[차관급] |
| 9대 | 박경배 (朴炅培) | 2009년 03월 12일 ~ 2010년 09월 12일 | [공공기관장] |
| 10대 | 박경국 (朴景國) | 2010년 09월 13일 ~ 2012년 11월 25일 | [장관급]
[차관급] |
| 11대 | 신진선 (辛鎭善) | 2012년 11월 26일 ~ 2014년 03월 18일 | |
| 12대 | 정정순 (鄭正淳) | 2014년 03월 19일 ~ 2015년 06월 12일 | [국회의원] |
| 13대 | 박제국 (朴堤國) | 2015년 06월 15일 ~ 2016년 06월 19일 | [차관급] |
| 14대 | 고규창 (高圭倉) | 2016년 06월 20일 ~ 2018년 07월 30일 | [차관급]
[공공기관장] |
| 15대 | 한창섭 (韓唱燮) | 2018년 07월 31일 ~ 2019년 12월 15일 | [차관급] |
| 16대 | 김장회 (金璋會) | 2019년 12월 16일 ~ 2021년 04월 30일 | [공공기관장] |
| 17대 | 서승우 (徐承佑) | 2021년 05월 01일 ~ 2022년 05월 09일 | |
| 직무대리 | | 2022년 05월 10일 ~ 2022년 07월 24일 | |
| 18대 | 이우종 (李雨鍾) | 2022년 07월 25일 ~ 2023년 09월 03일 | |
| 19대 | 정선용 (鄭善溶) | 2023년 09월 04일 ~ 현직 | |
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